GUIDE · 기장

약국 기장, 복식부기 장부를 매달 맞춰 두세요

약국은 전문직 사업자라 개업 첫해부터 복식부기 장부가 의무입니다. 매달 조제 수입과 판매 매출, 의약품 매입을 장부로 맞추고 연말에 재고까지 정리해 두면 부가세와 5월 신고가 함께 정리됩니다.

나승리 대표세무사작성·검토 나승리 대표세무사 · 2026년 10월 기준
핵심 요약
  • 약사업은 수입과 관계없이 복식부기의무자이고, 단순경비율과 기장세액공제를 적용받지 못합니다.
  • 장부 없이 추계로 신고하면 이 사례에서 세금이 2,273만원에서 3,429만원으로 늘어납니다(가상 사례).
  • 도매상 의약품 매입은 세금계산서를 받고 대금은 사업용계좌나 사업용 카드로 결제합니다.
  • 3만원을 넘는 경비는 적격증빙을 받아야 가산세가 없습니다.

약국은 왜 복식부기 장부가 의무인가요

약사업은 전문직 사업자라 수입 규모나 개업 시기와 관계없이 간편장부대상자에서 빠집니다. 그래서 개업 첫해부터 복식부기의무자이고, 장부 없이 신고할 때 쓰는 단순경비율도 적용할 수 없습니다. 간편장부대상자가 받는 기장세액공제도 약국에는 없습니다.

  • 장부는 조제 수입(공단부담금·본인부담금, 의료급여)과 일반의약품·건강기능식품 과세 매출을 나눠 적습니다.
  • 경비는 의약품 매입, 인건비, 임차료, 감가상각, 대출 이자, 카드 수수료, 리스료처럼 항목별로 정리합니다.
  • 연말에는 재고조사로 기말 재고를 빼고 그해 매출원가를 계산합니다.
  • 5월 신고 때 재무상태표와 손익계산서를 함께 냅니다.

장부로 신고할 때와 추계로 신고할 때

수입 7억 5,000만원, 장부상 경비 6억 4,500만원(그중 의약품 매입·임차료·인건비 6억 1,500만원)인 약국을 비교했습니다. 장부 없이 신고하면 기준경비율의 절반만 인정되고, 재무제표를 내지 않아 신고하지 않은 것으로 보아 가산세가 붙습니다.

표를 옆으로 밀면 나머지 칸도 볼 수 있습니다.

항목복식부기 장부장부 없이 추계
사업소득금액1억 500만원1억 2,000만원
가산세 (무신고·무기장 중 큰 것)-521만원
종합소득세 + 지방소득세2,273만원3,429만원

만원 단위 반올림(합계가 1만원 다를 수 있음). 이해를 돕기 위한 가상 사례이며 실제 세액은 약국 상황에 따라 달라집니다. 본인 인적공제 150만원과 성실사업자 표준세액공제 12만원(카드·현금영수증 가맹, 장부 신고, 사업용계좌 사용 요건)만 넣었습니다. 추계는 의약품 소매업(업종코드 523111)의 2025년 귀속 기준경비율 4.0%의 절반을 적용했고, 장부로 소득을 계산하지 않아 표준세액공제는 7만원입니다.

경비로 인정받는 증빙

거래받을 증빙메모
도매상 의약품 매입세금계산서조제용과 판매용을 나눠 정리, 반품은 반품 세금계산서
조기 결제 할인도매상 거래 원장, 할인 내역매입 금액에서 빼고, 할인율은 약사법 시행규칙 범위 안이어야 함
약봉투·소모품세금계산서, 카드사업용 카드로 결제
임차료·관리비세금계산서세금계산서를 못 받는 간이과세자 임대인이면 계좌로 보내고 경비 등 송금명세서 제출
자동조제기 구입·리스세금계산서, 리스 계약서운용리스·금융리스 구분
직원·근무약사 급여원천세 신고, 지급명세서장부 인건비와 금액이 맞아야 함
3만원 넘는 그 밖의 경비세금계산서·계산서·카드·현금영수증일반 영수증만 있으면 2% 가산세

기장을 맡기실 때 준비할 것

  1. 홈택스 수임 동의 (카드·현금영수증·세금계산서 자료)
  2. 사업용 통장과 사업용 카드 내역 (홈택스에 사업용 카드 등록)
  3. 직원·근무약사 명단과 근로계약서, 급여 내역
  4. 공단 지급 내역과 청구 프로그램·POS의 월별 합계
  5. 도매상별 거래 원장과 연말 재고조사표
  6. 대출 약정서, 장비 리스 계약서, 임대차계약서
이미 추계로 신고했다면

법정신고기한부터 5년 안에는 장부와 증빙을 갖춰 경정청구로 세금을 돌려받을 수 있는지 검토할 수 있습니다.

지역별 약국 기장 사례

233개 지역의 약국 기장 페이지마다 숫자를 달리한 계산 사례와 자주 묻는 질문을 정리했습니다. 지역 이름을 누르면 바로 볼 수 있습니다.

세종특별자치시

제주특별자치도

함께 보면 좋은 안내

5월 신고와 경비약국 종합소득세연말 재고조사약국 재고 관리개업 절차를 처음부터약국 개업 세무

자주 묻는 질문

약국도 간편장부를 쓸 수 있나요?

아닙니다. 약사업은 전문직 사업자라 간편장부대상자에서 빠지고, 첫해부터 복식부기 장부를 써야 합니다.

기장을 맡기면 무엇을 준비하나요?

홈택스 수임 동의, 사업용 통장과 카드, 직원 명단과 급여, 리스·대출 계약서, 공단 지급 내역과 청구 프로그램 매출 자료를 주시면 매달 장부를 정리합니다. 도매상 세금계산서는 홈택스로 대부분 받습니다.

의약품 재고도 장부에 적나요?

네. 복식부기 장부에서는 그해 의약품 매입액에 기초 재고를 더하고 기말 재고를 빼서 매출원가를 계산합니다. 연말 재고조사표를 남겨 두면 원가 근거가 됩니다.

장부를 쓰면 무엇이 달라지나요?

감가상각, 대출 이자, 카드 수수료, 리스료처럼 증빙이 흩어진 경비까지 실제 금액대로 반영되고, 추계 신고 때 붙는 가산세가 없습니다. 결손이 나면 다음 해로 넘겨 공제받을 수도 있습니다.

대표 지역 약국 기장 계산 사례

지역마다 숫자를 달리한 계산 사례부터 보세요.

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나승리 세무사
작성 · 검토
나승리 세무사 위너세무회계 대표세무사

약사님 약국의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.

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