약국 세무사
약사님은 조제에만,
세금은 저희가 챙깁니다
약국 세무는 면세 조제와 과세 판매, 공단 청구와 카드 매출, 의약품 매입과 재고가 한꺼번에 움직입니다. 매월 급여 원천세, 1월·7월 부가세, 5월 종합소득세까지 대표세무사가 1년 일정을 직접 챙기고, 전국 약국을 비대면으로 맡아 드립니다.
약국 세무, 여섯 가지를 함께 봅니다
신고서 몇 장이 아니라 약국 운영의 1년 일정을 함께 관리합니다.
약국 세금, 지금 바로 계산해 보세요
한 해 수입과 매출원가·경비로 종합소득세를, 근무약사 세후 월급으로 세전 월급과 대표 약사님 부담을 계산합니다.
경비 칸을 직접 고치기 전까지는 수입금액에 맞춰 매출원가 77%, 인건비 7%, 임차료 3%, 기타 3%로 채워 둡니다.
그해 수입금액이 15억원 이상이면 성실신고확인 대상이라 6월 30일까지, 그 밖에는 5월 31일까지 신고하고 냅니다.
- 연 수입금액
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- 필요경비
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- 사업소득금액
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- 소득공제
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- 과세표준
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- 산출세액
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- 연금계좌 세액공제
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- 표준세액공제 (성실사업자)
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- 지방소득세 (10%)
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- 세금 내고 남는 소득
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2026년 10월 현행 세율(6~45%)로 계산한 추정치입니다. 인적공제는 1명당 150만원, 노란우산공제는 사업소득금액에 따른 한도(600만~200만원), 연금계좌는 연 900만원 한도와 공제율(종합소득금액 4,500만원 초과 12%, 이하 15%), 성실사업자 표준세액공제 12만원(카드·현금영수증 가맹, 장부 신고, 사업용계좌 사용)을 반영했습니다. 약국은 전문직 사업자라 복식부기의무자이고 기장세액공제는 없습니다. 공단이 조제료에서 원천징수한 세금(3%), 중간예납, 성실신고확인비용과 고용 관련 세액공제, 자녀세액공제, 다른 소득은 반영하지 않았습니다.
매달 떼는 소득세는 간이세액표를 따르고, 1년 세금은 다음 해 2월 연말정산에서 확정됩니다. 지급명세서는 3월 10일까지 냅니다.
| 월 기준 | 금액 |
|---|---|
| 근무약사가 받는 금액 (Net) | - |
| 근로소득세 + 지방소득세1년 정산액의 1/12 | - |
| 4대보험 근무약사 몫 | - |
| 세전 월급 | - |
| 4대보험 사업주 몫 | - |
| 퇴직금 적립 (1/12) | - |
2026년 요율로 계산한 추정치입니다. 1년 내내 같은 월급을 받고 본인 공제만 받는다고 보고 연말정산 결정세액으로 계산했습니다. 국민연금 9.5%(각 4.75%, 2026년 7월부터 적용되는 기준소득월액 41만~659만원으로 1년 단순 계산), 건강보험 7.19%(각 3.595%), 장기요양 0.9448%(건강보험료의 13.14%, 각 절반), 고용보험 근로자 0.9%·사업주 1.15%(150인 미만), 산재보험은 출퇴근재해를 포함해 0.96%로 가정했습니다(사업장 고지 요율로 달라짐). 부양가족이나 다른 소득이 있으면 결과가 달라집니다.
첫 상담은 무료로 시작합니다
지금까지 어떻게 신고해 왔는지부터 듣고, 놓친 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 짚어 드립니다.
약국 형태와 수입 규모, 조제와 판매 비중, 근무약사·직원 구성, 지난해 신고서를 함께 보고 앞으로 1년의 신고 일정과 세금을 정리해 드립니다.
상담 신청하기신고 일정까지 한 번에
공단 지급 내역과 카드·현금 매출, 도매상 매입과 재고를 매달 정리하고, 급여 원천세와 1월·7월 부가세, 5월 종합소득세 신고까지 이어서 맡습니다. 신용카드 발행세액공제와 공통매입세액 안분도 함께 챙깁니다.
- STEP 01무료 상담전화, 카카오톡, 아래 신청서
- STEP 02자료 연결홈택스 수임 동의, 카드·통장 자료
- STEP 03매월 관리장부, 급여 원천세, 4대보험
- STEP 04신고1월·7월 부가세, 5월 종합소득세
상담 전에 지난해 종합소득세 신고서와 근무약사·직원 명단(급여 주는 방식)을 준비해 주시면 더 정확하게 봐 드립니다.
왜 위너인가?
"약국은 면세 조제와 과세 판매가 함께 들어오고, 의약품 매입과 재고가 소득을 좌우합니다.
그 흐름을 정확히 맞추는 일부터 대표세무사가 직접 챙깁니다."
약국 약사님이
가장 먼저 확인할 것
상담을 시작하면 많은 약사님이 이렇게 먼저 물으십니다.
조제는 면세지만, 실제 세금은 아래 네 가지에서 크게 달라집니다.
조제 결제와 판매 결제를 나눠 보고 있는가
신용카드 발행세액공제는 과세 매출 결제액에만 적용됩니다. 카드 단말기 합계를 그대로 넣으면 면세 조제 결제까지 섞여 나중에 가산세와 함께 돌려줘야 합니다.
매입 세금계산서를 조제용과 판매용으로 나눴는가
판매용 일반의약품 매입세액은 모두 공제받고, 조제용 매입세액은 공제받지 못합니다. 나눠 두지 않으면 공통 매입으로 보아 일부만 공제받게 됩니다.
연말 재고조사표를 남기고 있는가
약국은 매출원가가 수입의 대부분이라 기말 재고 금액이 조금만 달라져도 소득이 크게 흔들립니다. 12월 31일 재고조사표가 그해 원가의 근거입니다.
근무약사를 Net으로 계약했는가
세후 금액으로 계약해도 원천징수와 4대보험, 퇴직금은 세전 월급으로 계산합니다. 연말정산 환급금을 누가 가져가는지도 계약서에 적어야 합니다.
위너가 약국 세무를 관리하는 방식
한 번 신고하고 끝나는 일이 아니라 1년 내내 이어지는 일정입니다.
대표세무사가 자료 연결부터 신고까지 직접 챙깁니다.
약국 세무 1년 일정을 함께 관리합니다
홈택스 수임 동의와 카드·통장 자료를 연결하고, 공단 지급 내역과 청구 프로그램·POS 합계를 매달 받습니다.
직원·근무약사 급여 원천세(다음 달 10일)와 4대보험 변동, 도매상 매입·반품 증빙을 챙깁니다.
과세 판매와 면세 조제를 나눠 신고하고, 공통매입세액 안분과 신용카드 발행세액공제를 반영합니다.
연말 재고조사로 매출원가를 맞춰 신고하고, 수입 15억원 이상이면 성실신고확인까지 6월에 마칩니다.
약국 세무 검토 사례
비슷해 보여도 약국마다 확인할 순서가 다릅니다.
세후 월 500만원으로 계약했을 때
세전 월급을 역산해 급여 신고와 4대보험을 맞추고, 대표 약사님 월 부담과 연말정산 정산 주체를 계약서에 정리합니다.
조제 결제와 일반의약품 결제가 섞인 카드 매출
과세 매출 결제액만으로 발행세액공제를 계산하고, 매입 세금계산서를 조제용·판매용·공통으로 나눠 공통매입세액을 과세 비율대로 안분합니다.
12월에 의약품을 몰아 사 두려는 해
그해 쓴 만큼만 원가가 되므로 기말 재고조사로 원가를 맞추고, 반품·결제 할인·폐기를 장부에 반영해 5월 신고를 준비합니다.
권리금과 재고 값을 주고 약국을 넘겨받을 때
영업권 대가는 8.8%를 원천징수하고 5년에 나눠 상각하며, 넘겨받은 재고는 품목별로 정산해 매입원가로, 장비는 내용연수에 나눠 비용으로 넣습니다.
상담에서 자주 만나는 유형을 정리한 것이며, 실제 세액은 약국 규모와 계약 내용에 따라 달라집니다.
전국 어디서나
지역별·주제별 약국 세무 상담
전국 약국을 비대면 기장으로 맡고, 수도권은 광교 사무실 방문 상담도 합니다.
시·도와 시·군·구, 주제마다 약사님들이 자주 묻는 세무 질문을 사례로 정리했습니다.
7월 개업 약국, 감가상각과 초도 재고를 넣은 첫해 세금
개업 첫해 비용 처리 →02수원 영통 · 용인 수지 일부광교 약국 세무수입 6억 4,400만원 약국, 장부 신고 2,049만원과 추계 신고 2,943만원
장부와 추계 비교 →03화성시 동탄동탄 약국 세무과세 매출 1억 7,400만원, 안분과 카드 공제 뒤 1년 부가세 233만원
조제 면세와 판매 부가세 →04성남시 분당구분당 약국 세무영업권 대가 1억 5,000만원, 기타소득 합산으로 늘어나는 세금 2,503만원
약국 양도와 권리금 →05용인 수지 · 기흥 · 처인용인 약국 세무12월 의약품 4,700만원 추가 매입, 기말 재고를 빼면 원가와 세금은 그대로
재고와 매출원가 →06서울 강남구강남구 약국 세무권리금 1억 300만원 약국 인수, 영업권 7,600만원(원천징수 669만원)과 재고 6,800만원 정산
약국 인수와 권리금 →07서울 서초구서초구 약국 세무소득 1억 267만원 약사님, 노란우산 공제 200만원과 연금계좌 770만원으로 줄어드는 세금 178만원
공제 한도와 절세 →08서울 송파구송파구 약국 세무과세 매출 9,100만원, 안분과 카드 공제 뒤 1년 부가세 95만원
조제 면세와 판매 부가세 →약국 약사님이
자주 묻는 세금 문제
상담에서 자주 받는 질문을 주제별로 정리했습니다.
지금 상황과 가까운 안내부터 읽어 보세요.
개설 등록부터 사업자등록, 첫해 장부와 신고 일정
약국 개업 세무 안내 →약국 기장복식부기 장부와 의약품 매입 증빙, 월별 결산
약국 기장 안내 →약국 종합소득세5월 신고, 경비 반영과 조제료 원천징수 세액
약국 종합소득세 안내 →약국 성실신고수입 15억원부터 6월 30일 신고, 확인 준비와 가산세
약국 성실신고 안내 →약국 부가세조제 면세와 일반의약품 과세, 공통매입세액 안분
약국 부가세 안내 →약국 카드매출과 현금영수증신용카드 발행세액공제와 현금영수증 의무발행
약국 카드매출과 현금영수증 안내 →근무약사 급여와 세금Net 계약 세전 역산, 원천징수와 4대보험
근무약사 급여와 세금 안내 →약국 직원 4대보험2026년 요율과 약사님 부담, 두루누리 지원
약국 직원 4대보험 안내 →약국 공동개설동업계약서와 손익분배, 약사별 신고
약국 공동개설 안내 →약국 양도양수권리금 원천징수와 재고 정산, 폐업 부가세
약국 양도양수 안내 →약국 재고 관리연말 재고조사와 매출원가, 반품과 폐기 처리
약국 재고 관리 안내 →약국 절세노란우산·연금계좌, 고용세액공제와 경비 관리
약국 절세 안내 →약국 세무 자주 묻는 질문
약국 조제에도 부가세가 붙나요?
약사가 처방전에 따라 조제하는 의약품은 부가세가 면제됩니다. 처방 없이 파는 일반의약품과 의약외품, 건강기능식품, 화장품은 과세되어, 대부분의 약국은 면세와 과세를 함께 하는 겸영 사업자로 1월과 7월에 부가세를 신고합니다.
조제용 의약품을 살 때 낸 부가세는 돌려받나요?
돌려받지 못합니다. 면세 조제에 쓰는 매입이라 매입세액이 공제되지 않고 매입원가가 됩니다. 판매용 일반의약품 매입세액은 공제받고, 임차료처럼 함께 쓰는 매입의 부가세는 과세 매출 비율만큼만 공제받습니다.
약국도 복식부기 장부를 써야 하나요?
네. 약사업은 전문직 사업자라 수입 규모와 관계없이 개업 첫해부터 복식부기의무자입니다. 장부 없이 추계로 신고하면 단순경비율을 쓸 수 없고 기준경비율의 절반만 인정되며 가산세가 붙습니다.
약국도 간이과세자로 시작할 수 있나요?
아닙니다. 약사업은 간이과세 배제 업종이라 매출 규모와 관계없이 일반과세자로 사업자등록을 합니다.
카드 매출 발행세액공제는 얼마나 받나요?
2026년 12월 31일까지는 과세 매출의 카드·현금영수증 결제액에 1.3%를 곱해 연 1,000만원까지 받고, 그 기간 납부할 부가세를 넘지 못합니다. 면세 조제 결제는 카드로 받아도 대상이 아니고, 직전 연도 공급가액이 10억원을 넘으면 받을 수 없습니다.
현금으로 받은 약값도 현금영수증을 발급하나요?
약국은 현금영수증 의무발행업종이라 한 번에 10만원 이상을 현금이나 계좌이체로 받으면 손님이 요청하지 않아도 현금영수증을 발급해야 합니다. 발급하지 않은 금액의 20%가 가산세이고(건강보험·의료급여 조제분은 제외), 손님 정보를 모르면 받은 날부터 5일 안에 국세청 지정번호(010-000-1234)로 발급합니다.
성실신고확인은 언제 받나요?
약국은 의약품 소매업이라 그해 수입금액이 15억원 이상이면 성실신고확인 대상입니다. 약제비까지 수입에 들어가고, 세무사의 확인을 받아 6월 30일까지 신고하며 확인비용의 60%(최대 120만원)를 세액공제받습니다.
연말에 의약품을 많이 사 두면 세금이 줄어드나요?
의약품은 그해 쓴 만큼만 원가가 되고, 남은 재고는 기말 재고로 빼서 다음 해 원가로 넘어갑니다. 12월에 몰아 사도 그해 세금은 거의 달라지지 않으니 처방 흐름과 유효기간에 맞춰 사는 편이 낫습니다.
공단에서 받는 돈에도 세금을 떼나요?
공단은 요양급여비용 가운데 약제비를 뺀 조제료 부분에서 소득세 3%와 지방소득세 0.3%를 원천징수합니다. 이 세금은 5월 종합소득세에서 이미 낸 세금으로 뺍니다.
약국을 인수할 때 권리금은 어떻게 처리하나요?
권리금을 장비·인테리어 대가와 영업권 대가로 나누고, 남은 의약품 재고는 따로 정산합니다. 영업권 대가는 넘기는 약사님의 기타소득이라 지급할 때 8.8%를 원천징수하고, 인수한 쪽은 5년에 나눠 비용으로 넣습니다.
지방 약국도 맡길 수 있나요?
네. 홈택스 수임 동의로 카드·현금영수증·세금계산서 자료를 받고, 급여와 공단 지급 내역, 재고조사표는 메일이나 카카오톡으로 받기 때문에 지역과 관계없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 방문 상담은 광교 사무실에서 합니다.
상담료가 있나요?
첫 상담은 무료이고, 기장료는 상담 때 견적으로 먼저 안내해 드립니다.
1분이면 충분합니다, 약국 세무 상담 신청
신고 일정이 다가오기 전에 먼저 점검해 보세요.
대표세무사가 확인 후 직접 연락드립니다.
약국 약사님의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.
