REGION · 나주

나주 약국을 넘긴다면 권리금 세금과 폐업 부가세까지 챙기세요

나주는 2026년 7월 출범한 전남광주통합특별시(옛 전라남도)에 속합니다. 약국을 넘기는 해에는 그해 약국 소득에 영업권 대가의 기타소득이 더해집니다. 받을 때 떼인 8.8%로 끝나지 않고 5월에 정산합니다.

나승리 대표세무사작성·검토 나승리 대표세무사 · 2026년 10월 기준
핵심 요약
  • 영업권 대가 6,000만원을 받으면 기타소득금액 2,400만원이 더해져 세금이 882만원 늘어납니다(가상 사례).
  • 영업권 대가는 필요경비 60%를 뺀 40%가 기타소득금액이고, 받을 때 8.8%가 원천징수됩니다.
  • 폐업 때 남은 과세 재고는 포괄양수도가 아니면 잔존재화로 부가세가 과세됩니다.
  • 폐업한 달의 말일부터 25일 안에 폐업 부가세 확정신고를 하고, 5월 종합소득세로 마무리합니다.

나주에서 약국을 운영할 때 알아 둘 것

나주는 광주 남구·광산구·함평과 맞닿아 있습니다. 이 페이지에서는 나주에서 약국을 운영하는 약사님을 위해 양도 때 받는 권리금의 세금과 폐업 부가세를 사례로 정리했습니다.

약국은 약사나 한약사가 약국을 둘 곳을 관할하는 시장·군수·구청장(보건소)에 개설 등록을 하고, 등록을 마친 뒤 세무서에 일반과세자로 사업자등록을 합니다. 약국의 1년 신고는 1월·7월 부가세 확정신고와 5월 종합소득세가 기본이고, 연말에는 재고조사로 그해 매출원가를 맞춥니다.

시·도
전남광주통합특별시(옛 전라남도 지역)
개설 등록
약사·한약사가 관할 시장·군수·구청장(보건소)에 등록
고용세액공제 지역 구분
수도권 밖 (청년 등 1인당 1년차 1,000만원, 그 밖의 인원 700만원)
함께 보면 좋은 지역
광주 남구, 광산구, 함평, 영암
상담 방식
전화·화상 상담과 비대면 기장 (방문 없이 진행)

나주는 통합고용세액공제에서 수도권 밖에 해당해, 2026년에 청년 등 정규직을 늘리면 1인당 1년차 1,000만원, 2년차 1,900만원, 3년차 2,000만원을 기준으로 공제합니다.

나주 약국의 주제별 세무 사례도 따로 정리했습니다.

계산 사례: 영업권 대가 6,000만원을 받고 약국을 넘김

나주의 한 약사님이 2026년에 약국을 다른 약사님께 넘겼습니다. 영업권 대가로 6,000만원을 받았고, 그해 약국 사업소득금액은 8,600만원입니다.

표를 옆으로 밀면 다른 경우도 볼 수 있습니다.

항목영업권 대가 없을 때영업권 대가 반영
그해 사업소득금액8,600만원8,600만원
영업권 대가 6,000만원의 기타소득금액 (40%)-2,400만원
종합소득 과세표준8,450만원1억 850만원
종합소득세 + 지방소득세1,584만원2,466만원
이미 원천징수된 세금 (8.8%)--528만원
영업권 대가로 5월에 더 낼 세금-354만원

만원 단위 반올림(합계가 1만원 다를 수 있음). 이해를 돕기 위한 가상 사례이며 실제 세액은 약국 상황에 따라 달라집니다. 본인 인적공제 150만원과 성실사업자 표준세액공제 12만원(카드·현금영수증 가맹, 장부 신고, 사업용계좌 사용 요건)만 넣었습니다. 영업권 대가는 필요경비 60%를 뺀 40%가 기타소득금액이고, 받을 때 8.8%가 원천징수된다고 보았습니다. 장비 처분손익과 폐업 부가세는 이 표에 넣지 않았습니다.

영업권 대가의 40%인 2,400만원이 기타소득금액으로 사업소득에 더해져 세금이 882만원 늘어납니다. 받을 때 원천징수된 528만원을 빼고 5월에 차액을 냅니다.

재고도 따져 봐야 합니다. 넘겨받는 약사님에게 팔지 못하고 폐업할 때 남은 일반의약품 같은 과세 재고가 시가 850만원이라면, 포괄양수도가 아닌 경우 폐업 시 잔존재화로 부가세 85만원이 나옵니다. 남은 재고를 인수하는 약사님에게 넘기거나 도매상에 반품하면 이 부담을 줄일 수 있습니다.

폐업 부가세 신고 기한을 챙기세요

약국은 과세 매출이 있는 겸영 사업자라 폐업한 달의 말일부터 25일 안에 폐업 부가세 확정신고를 합니다. 이때 면세 조제 수입도 함께 신고하고, 5월에 종합소득세를 신고합니다.

약국 양도 마무리 순서

  1. 계약서: 영업권 대가와 장비·인테리어 대가, 재고 정산 방법, 직원 승계 조건을 나눠 적습니다.
  2. 폐업 신고: 보건소에 폐업 신고(7일 안)를 하고 세무서에도 폐업 신고를 합니다. 지위 승계로 넘기는 경우에는 넘겨받는 약사님이 승계 신고를 합니다.
  3. 직원 정산: 퇴직금과 4대보험 상실 신고, 마지막 달 원천세를 처리합니다.
  4. 폐업 부가세: 폐업한 달의 말일부터 25일 안에 확정신고하고, 남은 과세 재고가 있으면 함께 신고합니다.
  5. 다음 해 신고: 5월 종합소득세에 사업소득(장비 처분손익 포함)과 영업권 대가의 기타소득금액(40%)을 합산해 신고합니다.

나주 약사님이 자주 놓치는 것

  • 영업권 대가는 사업용 건물·토지와 함께 넘길 때는 양도소득으로 봅니다. 건물을 소유한 약국을 넘긴다면 계약 전에 따로 계산해 보세요.
  • 넘기는 해의 1월부터 폐업일까지 직원 급여와 4대보험 정산을 마쳐야 다음 해 신고가 깔끔합니다.
  • 한 번에 10만원 이상을 현금이나 계좌이체로 받으면 손님이 요청하지 않아도 현금영수증을 발급합니다. 발급하지 않은 금액의 20%가 가산세입니다(건강보험·의료급여 조제분은 제외).
  • 지난해 세금이 있으면 11월에 중간예납이 고지됩니다. 그해 실적이 크게 줄었다면 중간예납 추계액 신고를 검토합니다.

나주 약국 세무 상담은 이렇게 진행합니다

나주 약국은 방문 없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 상담은 전화·화상으로 하고, 카드·현금영수증·세금계산서 자료는 홈택스 수임 동의로, 급여 내역과 공단 지급 내역은 메일이나 카카오톡으로 받습니다. 양도 계약서, 장비 장부가액 자료, 재고 목록, 폐업 일정을 보내 주시면 첫 상담에서 바로 점검해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

광주 남구, 광산구, 함평 약국 사례와 전남 약국 세무 안내도 함께 참고해 보세요.

함께 보면 좋은 안내

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자주 묻는 질문

나주에서 약국을 열면 개설 등록은 어디에 하나요?

약국은 약사나 한약사가 약국을 둘 곳을 관할하는 시장·군수·구청장에게 등록하고, 등록은 관할 보건소에서 접수합니다. 등록을 마친 뒤 세무서에 일반과세자로 사업자등록을 합니다.

넘기는 장비 값도 세금이 붙나요?

복식부기의무자가 사업용 유형자산을 넘기면 받은 금액에서 장부가액을 뺀 처분이익이 사업소득에 들어갑니다. 장부가액보다 싸게 넘기면 처분손실이 됩니다.

약국을 넘기며 받은 권리금은 어떻게 과세되나요?

영업권 대가는 기타소득으로 필요경비 60%를 뺀 40%가 소득금액이 되고, 그해 다른 소득과 합산해 종합소득세를 냅니다. 받을 때 원천징수된 8.8%는 5월 신고 때 이미 낸 세금으로 뺍니다.

폐업할 때 남은 재고에도 부가세가 나오나요?

포괄양수도가 아니면 폐업할 때 남은 과세 재고와 장비는 시가로 공급한 것으로 보아 부가세가 과세됩니다. 조제용으로 매입세액을 공제받지 않은 재고는 대상이 아닙니다.

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지역마다 약국 규모와 직원 구성이 달라 자주 받는 질문도 다릅니다.

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약국 매출 구성(조제·일반약)과 직원 구성, 지난해 신고 방법만 알려 주시면 놓치고 있는 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 정리해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

나승리 세무사
작성 · 검토
나승리 세무사 위너세무회계 대표세무사

약사님 약국의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.

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