REGION · 거창

거창 약국 부가세, 면세 조제와 과세 판매를 나눠 신고하세요

약국 조제는 부가세가 면제되지만 일반의약품과 건강기능식품 판매는 과세됩니다. 그래서 약국은 면세와 과세를 함께 하는 겸영 사업자로 1월과 7월에 부가세를 신고합니다.

나승리 대표세무사작성·검토 나승리 대표세무사 · 2026년 10월 기준
핵심 요약
  • 과세 매출 공급가액 8,200만원이면 매출세액 820만원에서 매입세액과 카드 공제를 빼고 1년에 84만원을 냅니다(가상 사례).
  • 약사가 처방전에 따라 조제하는 의약품은 면세이고, 일반의약품·의약외품·건강기능식품 판매는 과세됩니다.
  • 조제용 의약품 매입의 부가세는 돌려받지 못하고, 함께 쓰는 매입의 부가세는 과세 매출 비율만큼만 돌려받습니다.
  • 부가세 확정신고 때 면세 조제 수입도 함께 신고하면 사업장현황신고를 따로 하지 않아도 됩니다.

거창 약국, 개설과 신고는 이렇게 시작합니다

거창은 함양·합천·무주와 맞닿아 있습니다. 이 페이지에서는 거창에서 약국을 운영하는 약사님을 위해 조제 면세와 일반의약품 과세 매출의 부가세를 사례로 정리했습니다.

약국 개설은 관할 보건소에 등록하고, 등록을 마친 뒤 사업자등록과 건강보험심사평가원 요양기관 현황 신고를 이어서 합니다. 조제와 일반의약품 판매를 함께 하는 약국은 1월과 7월에 부가세를 신고하면서 면세 조제 수입도 함께 신고하고, 5월에 종합소득세를 신고합니다.

시·도
경상남도
개설 등록
약사·한약사가 관할 시장·군수·구청장(보건소)에 등록
고용세액공제 지역 구분
수도권 밖 (청년 등 1인당 1년차 1,000만원, 그 밖의 인원 700만원)
함께 보면 좋은 지역
함양, 합천, 무주, 장수
상담 방식
전화·화상 상담과 비대면 기장 (방문 없이 진행)

거창은 통합고용세액공제에서 수도권 밖에 해당해, 2026년에 청년 등 정규직을 늘리면 1인당 1년차 1,000만원, 2년차 1,900만원, 3년차 2,000만원을 기준으로 공제합니다.

거창 약국의 주제별 세무 사례도 따로 정리했습니다.

계산 사례: 조제와 판매를 함께 하는 약국의 부가세

거창의 한 약국은 처방전 조제로 1년 4억 2,200만원의 면세 수입이 있고, 일반의약품과 건강기능식품을 팔아 부가세를 빼고 8,200만원의 과세 매출을 올렸습니다. 판매용 의약품을 사며 낸 부가세가 558만원, 임차료와 관리비처럼 조제와 판매에 함께 쓴 매입의 부가세가 450만원입니다.

표를 옆으로 밀면 다른 경우도 볼 수 있습니다.

항목1년반기(1기 또는 2기)
과세 매출 공급가액8,200만원4,100만원
매출세액 (10%)820만원410만원
판매용 의약품 매입세액-558만원-279만원
공통 매입세액 중 과세 비율 16.3%-73만원-37만원
신용카드 발행세액공제 (1.3%)-106만원-53만원
내야 할 부가세84만원42만원

만원 단위 반올림. 이해를 돕기 위한 가상 사례입니다. 공통 매입세액(임차료·관리비·인테리어 등의 부가세)은 그 과세기간의 과세·면세 공급가액 비율로 나눴고, 과세 매출의 90%를 카드·현금영수증으로 받았다고 보았습니다. 반기 금액은 1년의 절반으로 단순화했습니다. 실제로는 1월~6월, 7월~12월 실적으로 따로 계산합니다.

과세 매출의 매출세액 820만원에서 판매용 매입세액과 공통 매입세액 중 과세 비율(16.3%)만큼인 73만원을 빼고, 신용카드 발행세액공제 106만원까지 빼면 1년에 84만원을 냅니다.

조제에 쓰려고 산 의약품의 부가세(이 사례에서 약 2,954만원)와 공통 매입세액의 나머지 377만원은 면세 조제 몫이라 돌려받지 못하고 매입원가나 자산 가액이 됩니다. 매입 세금계산서를 조제용과 판매용으로 나눠 두지 않으면 판매용 매입세액까지 공통 매입으로 보아 일부만 공제받게 됩니다.

가격표가 부가세 포함인지 확인하세요

손님에게 받은 금액이 부가세 포함이라면 공급가액은 받은 돈의 100/110입니다. 이 사례에서 손님에게 받은 과세 매출은 9,020만원이고, 그중 820만원이 부가세입니다.

약국 부가세 신고 순서

  1. 매출 구분: 청구 프로그램의 조제 수입과 POS의 과세 판매 매출을 매달 나눠 합계를 냅니다.
  2. 매입 구분: 도매상 세금계산서를 조제용 의약품, 판매용 일반의약품·건강기능식품, 임차료·관리비 같은 공통 매입으로 나눠 정리합니다.
  3. 예정고지: 4월과 10월에는 직전 기간 세액의 절반이 고지되고, 50만원 미만이면 고지하지 않습니다.
  4. 확정신고: 1기분은 7월 25일, 2기분은 다음 해 1월 25일까지 신고하고, 면세 조제 수입도 함께 적습니다.
  5. 5월 연결: 부가세 신고의 과세 매출과 면세 수입을 합친 금액이 5월 종합소득세 수입금액과 맞는지 확인합니다.

놓치기 쉬운 것

  • 약사업은 면세 수입금액을 적게 신고하면 빠뜨린 금액의 0.5%가 가산세입니다. 부가세 신고 때 조제 수입도 청구 프로그램 합계와 맞춰 적으세요.
  • 생리대처럼 법으로 면세로 정한 품목은 조제가 아니어도 면세입니다. 품목별 과세 구분을 POS에 맞게 설정해 두세요.
  • 업무용 승용차는 운행기록을 작성하지 않으면 관련 비용 인정 한도가 1년 1,500만원입니다. 업무전용자동차보험은 약국처럼 전문직 업종이거나 성실신고확인 대상이면 업무용 승용차 1대부터 가입해야 관련 비용을 제대로 인정받습니다.
  • 임차보증금은 돌려받는 돈이라 비용이 아닙니다. 권리금을 냈다면 영업권으로 잡아 5년에 나눠 비용으로 넣습니다.

거창 약국 세무 상담은 이렇게 진행합니다

거창 약국은 방문 없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 상담은 전화·화상으로 하고, 카드·현금영수증·세금계산서 자료는 홈택스 수임 동의로, 급여 내역과 공단 지급 내역은 메일이나 카카오톡으로 받습니다. 청구 프로그램 조제 수입 합계, POS 과세 매출 자료, 도매상 매입 세금계산서를 보내 주시면 첫 상담에서 바로 점검해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

함양, 합천, 무주 약국 사례와 경남 약국 세무 안내도 함께 참고해 보세요.

함께 보면 좋은 안내

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자주 묻는 질문

거창에서 약국을 열면 개설 등록은 어디에 하나요?

약국은 약사나 한약사가 약국을 둘 곳을 관할하는 시장·군수·구청장에게 등록하고, 등록은 관할 보건소에서 접수합니다. 등록을 마친 뒤 세무서에 일반과세자로 사업자등록을 합니다.

공통 매입세액은 어떻게 나누나요?

조제와 판매에 함께 쓴 임차료, 관리비, 인테리어의 부가세는 그 과세기간의 과세 공급가액 비율만큼만 매입세액으로 공제합니다. 나머지는 경비나 자산 가액이 됩니다.

약국 조제에도 부가세가 붙나요?

아닙니다. 약사가 처방전에 따라 조제하는 의약품은 면세입니다. 처방 없이 파는 일반의약품, 의약외품, 건강기능식품, 화장품은 과세됩니다.

약국도 사업장현황신고를 하나요?

부가세 확정신고 때 면세 조제 수입까지 함께 적어 냈다면 사업장현황신고를 한 것으로 봅니다. 신고 내용과 실제 수입이 맞는지는 5월 전에 다시 확인합니다.

다른 지역 약국 세무 상담

지역마다 약국 규모와 직원 구성이 달라 자주 받는 질문도 다릅니다.

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거창 약국 세무, 우리 약국 기준으로 점검해 드립니다

약국 매출 구성(조제·일반약)과 직원 구성, 지난해 신고 방법만 알려 주시면 놓치고 있는 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 정리해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

나승리 세무사
작성 · 검토
나승리 세무사 위너세무회계 대표세무사

약사님 약국의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.

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