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대전 서구 약국 부가세 세무사, 매입 세금계산서를 조제용과 판매용으로 나누세요

약국 조제는 부가세가 면제되지만 일반의약품, 의약외품, 건강기능식품 판매는 과세됩니다. 과세와 면세가 섞인 겸영 사업자라 1월과 7월 부가세 신고에서 매입세액을 나누는 계산이 핵심입니다. 이 페이지에서는 조제 면세와 일반의약품 과세 매출의 부가세를 대전 서구 약국 사례로 계산해 정리했습니다.

나승리 대표세무사작성·검토 나승리 대표세무사 · 2026년 10월 기준
핵심 요약
  • 과세 매출 공급가액 1억 6,600만원이면 매출세액 1,660만원에서 매입세액과 카드 공제를 빼고 1년에 238만원을 냅니다(가상 사례).
  • 개인 약국은 1기분을 7월 25일, 2기분을 다음 해 1월 25일까지 확정신고합니다. 4월과 10월에는 직전 기간 세액의 절반이 예정고지되고, 50만원 미만이면 고지하지 않습니다.
  • 부가세 확정신고 때 면세 조제 수입까지 함께 신고하면 사업장현황신고를 따로 하지 않아도 됩니다.
  • 대전 서구 약국도 방문 없이 전화·화상 상담과 비대면 기장으로 맡기실 수 있습니다.

대전 서구 약국 부가세, 이것부터 챙기세요

약국의 1년 신고는 1월·7월 부가세 확정신고와 5월 종합소득세가 기본이고, 연말에는 재고조사로 그해 매출원가를 맞춥니다.

  • 약사가 처방전에 따라 조제하는 의약품은 면세이고, 일반의약품, 의약외품, 건강기능식품, 화장품 판매는 과세됩니다.
시·도
대전광역시
개설 등록
약사·한약사가 관할 시장·군수·구청장(보건소)에 등록
고용세액공제 지역 구분
수도권 밖 (청년 등 1인당 1년차 1,000만원, 그 밖의 인원 700만원)
함께 보면 좋은 지역
대전 중구, 계룡, 유성구, 대덕구
상담 방식
전화·화상 상담과 비대면 기장 (방문 없이 진행)

계산 사례: 조제와 판매를 함께 하는 약국의 부가세

대전 서구의 한 약국은 처방전 조제로 1년 7억 8,200만원의 면세 수입이 있고, 일반의약품과 건강기능식품을 팔아 부가세를 빼고 1억 6,600만원의 과세 매출을 올렸습니다. 판매용 의약품을 사며 낸 부가세가 1,112만원, 임차료와 관리비처럼 조제와 판매에 함께 쓴 매입의 부가세가 520만원입니다.

표를 옆으로 밀면 다른 경우도 볼 수 있습니다.

항목1년반기(1기 또는 2기)
과세 매출 공급가액1억 6,600만원8,300만원
매출세액 (10%)1,660만원830만원
판매용 의약품 매입세액-1,112만원-556만원
공통 매입세액 중 과세 비율 17.5%-91만원-46만원
신용카드 발행세액공제 (1.3%)-218만원-109만원
내야 할 부가세238만원119만원

만원 단위 반올림. 이해를 돕기 위한 가상 사례입니다. 공통 매입세액(임차료·관리비·인테리어 등의 부가세)은 그 과세기간의 과세·면세 공급가액 비율로 나눴고, 과세 매출의 92%를 카드·현금영수증으로 받았다고 보았습니다. 반기 금액은 1년의 절반으로 단순화했습니다. 실제로는 1월~6월, 7월~12월 실적으로 따로 계산합니다.

과세 매출의 매출세액 1,660만원에서 판매용 매입세액과 공통 매입세액 중 과세 비율(17.5%)만큼인 91만원을 빼고, 신용카드 발행세액공제 218만원까지 빼면 1년에 238만원을 냅니다.

조제에 쓰려고 산 의약품의 부가세(이 사례에서 약 5,474만원)와 공통 매입세액의 나머지 429만원은 면세 조제 몫이라 돌려받지 못하고 매입원가나 자산 가액이 됩니다. 도매상 세금계산서 가운데 판매용 일반의약품 매입을 따로 모아 두어야 그 매입세액을 모두 공제받을 수 있습니다.

가격표가 부가세 포함인지 확인하세요

손님에게 받은 금액이 부가세 포함이라면 공급가액은 받은 돈의 100/110입니다. 이 사례에서 손님에게 받은 과세 매출은 1억 8,260만원이고, 그중 1,660만원이 부가세입니다.

약국 부가세 신고 순서

  1. 매출 구분: 청구 프로그램의 조제 수입과 POS의 과세 판매 매출을 매달 나눠 합계를 냅니다.
  2. 카드 매출: 과세 매출 가운데 카드·현금영수증 결제액을 따로 집계해 발행세액공제에 씁니다.
  3. 예정고지: 4월과 10월에는 직전 기간 세액의 절반이 고지되고, 50만원 미만이면 고지하지 않습니다.
  4. 확정신고: 1기분은 7월 25일, 2기분은 다음 해 1월 25일까지 신고하고, 면세 조제 수입도 함께 적습니다.
  5. 5월 연결: 부가세 신고의 과세 매출과 면세 수입을 합친 금액이 5월 종합소득세 수입금액과 맞는지 확인합니다.

부가세 관련해 자주 놓치는 것

  • 약사업은 면세 수입금액을 적게 신고하면 빠뜨린 금액의 0.5%가 가산세입니다. 부가세 신고 때 조제 수입도 청구 프로그램 합계와 맞춰 적으세요.
  • 생리대처럼 법으로 면세로 정한 품목은 조제가 아니어도 면세입니다. 품목별 과세 구분을 POS에 맞게 설정해 두세요.
  • 청구 프로그램과 판매 POS의 매출을 과세와 면세로 나눠 매달 맞춰 두세요. 한 금액으로 섞이면 과세 매출을 따로 증명하기 어렵습니다.
  • 직원 급여의 원천세는 지급한 달의 다음 달 10일까지 신고·납부합니다. 직원이 적은 약국은 반기별 납부를 신청할 수 있습니다.

대전 서구 약국 부가세 상담은 이렇게 진행합니다

대전 서구 약국은 방문 없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 상담은 전화·화상으로 하고, 카드·현금영수증·세금계산서 자료는 홈택스 수임 동의로, 급여 내역과 공단 지급 내역은 메일이나 카카오톡으로 받습니다. 청구 프로그램 조제 수입 합계, POS 과세 매출 자료, 도매상 매입 세금계산서를 보내 주시면 첫 상담에서 바로 점검해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

대전 서구의 다른 약국 세무 사례는 대전 서구 약국 세무에, 다른 지역의 부가세 사례는 약국 부가세 안내에 모아 두었습니다.

함께 보면 좋은 안내

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자주 묻는 질문

약국 조제에도 부가세가 붙나요?

아닙니다. 약사가 처방전에 따라 조제하는 의약품은 면세입니다. 처방 없이 파는 일반의약품과 의약외품, 건강기능식품, 화장품은 과세됩니다.

공통 매입세액은 어떻게 나누나요?

조제와 판매에 함께 쓴 임차료, 관리비, 인테리어의 부가세는 그 과세기간의 과세 공급가액 비율만큼만 매입세액으로 공제합니다. 나머지는 경비나 자산 가액이 됩니다.

약국도 사업장현황신고를 하나요?

부가세 확정신고 때 면세 조제 수입까지 함께 적어 냈다면 사업장현황신고를 한 것으로 봅니다. 신고 내용과 실제 수입이 맞는지는 5월 전에 다시 확인합니다.

조제용 의약품을 살 때 낸 부가세는 돌려받나요?

돌려받지 못합니다. 면세 조제에 쓰는 매입이라 매입세액이 공제되지 않고, 부가세를 포함한 금액이 매입원가가 됩니다. 판매용 일반의약품 매입세액만 공제받습니다.

가까운 지역 약국 부가세 상담

같은 부가세라도 지역과 약국 규모에 따라 자주 받는 질문이 다릅니다.

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대전 서구 약국 부가세, 우리 약국 기준으로 점검해 드립니다

약국 매출 구성(조제·일반약)과 직원 구성, 지난해 신고 방법만 알려 주시면 놓치고 있는 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 정리해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

나승리 세무사
작성 · 검토
나승리 세무사 위너세무회계 대표세무사

약사님 약국의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.

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