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무안 약국 개업 세무사, 인수 권리금의 원천징수와 상각부터 확인하세요

약국 개업은 개설 등록과 사업자등록, 인테리어·조제 장비 계약, 첫 의약품 입고와 직원 채용이 한꺼번에 몰리는 시기입니다. 이때 받은 증빙과 정한 장부 방식이 첫해 세금을 좌우합니다. 이 페이지에서는 약국을 인수할 때 내는 권리금의 원천징수와 재고 정산을 무안 약국 사례로 계산해 정리했습니다.

나승리 대표세무사작성·검토 나승리 대표세무사 · 2026년 10월 기준
핵심 요약
  • 영업권 대가 1억 4,200만원을 줄 때 1,250만원을 원천징수하고, 영업권은 5년 동안 1년에 2,840만원씩 비용이 됩니다(가상 사례).
  • 약사는 약국을 하나만 열 수 있고, 법인은 약국을 개설할 수 없습니다. 2026년 11월 27일부터는 약사·한약사가 어떤 명목으로도 둘 이상의 약국을 개설하거나 운영할 수 없습니다.
  • 약사업은 간이과세를 받을 수 없어 처음부터 일반과세자로 사업자등록을 합니다.
  • 무안 약국도 방문 없이 전화·화상 상담과 비대면 기장으로 맡기실 수 있습니다.

무안 약국 개업 세무 포인트

약국의 1년 신고는 1월·7월 부가세 확정신고와 5월 종합소득세가 기본이고, 연말에는 재고조사로 그해 매출원가를 맞춥니다.

  • 약국은 전문직 사업자라 개업 첫해부터 복식부기 장부를 쓰고, 개업한 해의 다음 해 6월 30일까지 사업용계좌를 신고합니다.
  • 처음 들여온 의약품은 그해 경비가 아니라 재고로 잡고, 팔거나 조제에 쓴 만큼 원가가 됩니다.
  • 약국은 약사와 한약사만 열 수 있고, 약국을 둘 곳을 관할하는 시장·군수·구청장(보건소)에 개설 등록을 합니다.
시·도
전남광주통합특별시(옛 전라남도 지역)
개설 등록
약사·한약사가 관할 시장·군수·구청장(보건소)에 등록
고용세액공제 지역 구분
수도권 밖 (청년 등 1인당 1년차 1,000만원, 그 밖의 인원 700만원)
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목포, 함평, 영암, 나주
상담 방식
전화·화상 상담과 비대면 기장 (방문 없이 진행)

계산 사례: 권리금 1억 9,000만원에 약국 인수

한 약사님이 무안에서 운영 중인 약국을 권리금 1억 9,000만원에 인수했습니다. 계약서에는 장비·인테리어 대가 4,800만원과 영업권(입지·처방 흐름·단골 등) 대가 1억 4,200만원을 나눠 적었고, 남은 의약품 재고 9,100만원은 따로 정산했습니다.

표를 옆으로 밀면 나머지 칸도 볼 수 있습니다.

구분금액처리
권리금 합계1억 9,000만원
장비·인테리어 대가 (유형자산)4,800만원5년 감가상각, 1년 960만원
영업권 대가 (무형자산)1억 4,200만원5년 상각, 1년 2,840만원
영업권 대가 원천징수 (8.8%)1,250만원지급한 달의 다음 달 10일까지 신고·납부
넘겨받은 의약품 재고 (권리금과 별도)9,100만원매입원가, 쓰는 만큼 원가

만원 단위 반올림. 이해를 돕기 위한 가상 사례입니다. 영업권 대가는 넘기는 약사님의 기타소득(필요경비 60%)으로 보아 지급액의 8.8%(소득세 8% + 지방소득세 0.8%)를 원천징수한다고 보았습니다. 장비·인테리어는 내용연수 범위(4~6년) 안에서 5년을 신고해 정액법으로 나눈다고 가정했고, 포괄양수도가 아닌 거래로 보았습니다.

영업권 대가 1억 4,200만원을 지급할 때 인수하는 약사님이 1,250만원을 원천징수해 다음 달 10일까지 내고, 지급명세서는 다음 해 2월 말일까지 냅니다. 영업권은 5년 동안 1년에 2,840만원씩, 장비·인테리어는 5년 동안 1년에 960만원씩 비용이 됩니다.

포괄양수도가 아니면 넘겨받은 재고 9,100만원 전체에 부가세 910만원이 붙은 세금계산서를 받습니다. 그중 판매용 일반의약품 2,548만원의 매입세액 255만원은 공제받고, 조제용 전문의약품 몫은 공제받지 못해 매입원가가 됩니다. 인수일 재고조사표에 품목, 수량, 단가, 유효기간을 함께 적어 두면 원가 계산과 반품 정리가 쉬워집니다.

포괄양수도라면 세금계산서가 달라집니다

사업에 관한 모든 권리와 의무를 그대로 넘겨받는 포괄양수도는 재화의 공급으로 보지 않아 재고와 장비에 세금계산서를 발급하지 않습니다. 계약서에 포괄양수도인지 분명히 적어 두세요.

약국을 인수할 때 순서대로 할 일

  1. 계약서: 장비·인테리어 목록과 금액, 영업권 대가, 재고 정산 방법을 나눠 적습니다.
  2. 재고조사: 인수일에 품목별 수량과 단가, 유효기간을 확인하고 판매용과 조제용을 나눠 정산합니다.
  3. 원천징수: 영업권 대가를 지급한 달의 다음 달 10일까지 원천세를 신고·납부합니다.
  4. 개설·등록: 지위 승계 신고(승계한 날부터 1개월 안) 또는 새 개설 등록을 하고 사업자등록을 합니다.
  5. 장부: 영업권과 장비를 자산으로 잡고 첫해부터 상각하며, 재고는 기초 재고로 잡습니다.

개업 관련해 자주 놓치는 것

  • 인수 전에 넘기는 약사님의 체납 세금과 4대보험이 없는지 확인하세요. 사업 양수인에게 제2차 납세의무가 생기는 경우가 있습니다.
  • 자동조제기를 리스로 쓰던 약국을 넘겨받는다면 남은 리스료와 승계 조건을 계약서에 따로 적어 두세요.
  • 개업 전 인테리어비, 간판, 조제 장비, 채용 비용도 약국 사업과 관련된 지출이면 비용이나 자산이 됩니다. 사업자등록 전이라면 대표자 주민등록번호로 세금계산서를 받아 두세요.
  • 임차보증금은 돌려받는 돈이라 비용이 아니고, 권리금을 냈다면 영업권으로 잡아 5년에 나눠 비용으로 넣습니다.
  • 2026년 10월 1일 국회를 통과한 약사법 개정안(공포 6개월 뒤 시행)에 따라 개설 등록이나 지위승계 신고 때 보건복지부령으로 정하는 자료(임대차계약서·자금 출처 자료 등이 거론됨)를 요구받을 수 있고, 내지 않으면 신청이 반려될 수 있습니다. 계약서와 자금 흐름을 처음부터 정리해 두세요.
  • 한 번에 10만원 이상을 현금이나 계좌이체로 받으면 손님이 요청하지 않아도 현금영수증을 발급합니다. 발급하지 않은 금액의 20%가 가산세입니다(건강보험·의료급여 조제분은 제외).

무안 약국 약사님 상담 방법

무안 약국은 방문 없이 비대면으로 기장과 신고를 맡기실 수 있습니다. 상담은 전화·화상으로 하고, 카드·현금영수증·세금계산서 자료는 홈택스 수임 동의로, 급여 내역과 공단 지급 내역은 메일이나 카카오톡으로 받습니다. 양도양수 계약서, 장비 목록과 금액, 인수일 재고조사표, 권리금 지급 내역을 보내 주시면 첫 상담에서 바로 점검해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

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자주 묻는 질문

약국 개업하면 사업자등록은 언제 하나요?

보건소에서 약국 개설 등록을 마친 뒤 세무서에 사업자등록을 합니다. 사업을 시작한 날부터 20일 안에 신청하고, 개설 등록증과 임대차계약서를 준비합니다. 이어서 건강보험심사평가원에 요양기관 현황을 신고합니다.

약국을 인수하면 개설 등록을 새로 하나요?

약국은 영업을 양도받은 약사가 약국개설자의 지위를 승계할 수 있고, 승계한 날부터 1개월 안에 신고합니다. 넘기는 약사님이 폐업하고 새로 개설 등록을 하는 방법도 있습니다.

권리금도 경비가 되나요?

네. 영업권 대가는 무형자산으로 잡아 5년에 나눠 비용으로 넣고, 장비·인테리어 대가는 유형자산으로 감가상각합니다.

권리금을 줄 때 원천징수를 해야 하나요?

영업권 대가는 넘기는 약사님의 기타소득이라 지급할 때 8.8%를 원천징수하고 다음 달 10일까지 신고·납부합니다. 지급명세서는 다음 해 2월 말일까지 냅니다.

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약국 매출 구성(조제·일반약)과 직원 구성, 지난해 신고 방법만 알려 주시면 놓치고 있는 신고와 줄일 수 있는 세금을 먼저 정리해 드립니다. 첫 상담은 무료입니다.

나승리 세무사
작성 · 검토
나승리 세무사 위너세무회계 대표세무사

약사님 약국의 기장과 부가세, 종합소득세 신고를 함께 관리하고 있습니다. 법령과 요율은 2026년 10월 기준이며 최종 검토일은 2026.10.21입니다.

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